质谱法基因分型技术简介

DNA质谱阵列基因分析系统以其通量高、自动化、灵活、结果准确、实验成本低廉等诸多优势成为了全球著名大学、医学生物学研究所、生物技术公司、制药企业、疾控中心等机构所推崇的研究工具。应用领域涵盖医学及转化医学、分子生物学、基因组学、表观遗传学、农业遗传育种及转基因技术等相关领域。

 
检测仪器信息 

Sequenom MassArray时间飞行质谱生物芯片系统是为基因组学研究提供兼顾灵敏度和特异性服务的中高通量技术平台，广泛地应用于遗传突变检测、SNP分型以及DNA甲基化定量分析研究，是目前唯一采用质谱法进行直接检测的设备。

Sequenom MassArray系统反应体系为非杂交依赖性，不需要各种标记物，实验设计灵活，更可实现高达40重反应，是目前市场上拥有最高性价比的产品。

Sequenom MassArray特定SNP位点检测服务采用专业的引物设计和基因分型软件，可对95%以上已被证实的SNP进行实验设计，特别适合于SNP位点小于200个，样本量大于500份的项目。实验过程无需荧光标记，大大降低每次基因型分析的成本。

 
 
检测原理 

Sequenom MassARRAY® 分子量阵列技术是Sequenom 公司推出的世界上领先的基因分析工具，通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDI-TOF质谱技术相结合，经过PCR扩增,SAP酶处理, 延伸引物单碱基延伸,树脂除盐纯化, 芯片点样, 质谱检测等实验步骤，最终使用Typer4.0 软件分析实验数据，获得基因分型结果。

具体原理：Sequenom MassArray系统主要是利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 进行分析，即PCR扩增产物或者预处理样本在延伸单碱基后，将制备的样品分析物与芯片基质共结晶，将该晶体放入质谱仪的真空管，而后用瞬时纳秒 (10^-9s) 强激光激发，由于基质分子经辐射所吸收的能量，导致能量蓄积并迅速产热，从而使基质晶体升华，核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子，产生的离子多为单电荷离子，这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能，进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率得以分离，在真空小管中飞行到达检测器。

检测应用

中高通量SNP基因型分析
GWAS及二代测序验证
肿瘤体细胞基因突变谱分析
基因表达定量及目标基因CNV分析
DNA甲基化定位定量
病原体分子分型
 
技术优势

定制灵活：可以自由选择感兴趣的SNP位点一张芯片上，样本的数量和位置可以自由选择一张芯片上，样本和SNP位点的配对可以自由选择。
分析准确：直接检测待测物分子量，准确度超过99.7%。质谱技术灵活检测PCR实验失败或三等位基因的存在。可重复性高，每个样品将要检测到SNP位点最适合精细定位和芯片实验的后续研究。
高通量检测：一张芯片上可完成384个样品的多重iPLEX GOLD实验；每个反应孔最高可实现多达40重反应；每天可进行高达十万次基因型分析
  
检测服务流程

1、客户提供DNA或者生物样本，并指定需要检测SNP位点(rs编号)

2、设计引物(包括PCR扩增引物和单碱基延伸引物)

3、样本制备PCR扩增、SAP处理、单碱基延伸

4、点样制备检测用芯片阵列

5、MALDI-TOF质谱检测

6、数据分析、给出分型报告

样本要求

基因组DNA: 总量大于10 ng（视检测位点数量递增）

A260/280在1.8-2.0

A260/230大于1.8

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