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本发明提供了一种具有极酸性pH响应的近红外荧光探针，化学结构式如式(Ⅰ)所示：式中，X为‑C(CH3)2‑、‑O‑、‑S‑或‑Se‑，Z为或以‑R'NH2所示的基团，其中，R'为C1‑12的亚烷基，R1和R2分别独立地选自H原子、C1‑18烷基或以‑SO3R5所示的基团，其中，R5为C1‑18烷基或苄基，R3和R4分别独立地选自C1‑18烷基或苄基，Y为F、Cl、Br或I。该近红外荧光探针具有较低的pKa值，对H+有较高的灵敏度、高选择性、stocks位移较大、背景干扰小，对细胞和活体伤害较小，很适合用来进行极酸环境下pH的检测，克服了现有技术荧光探针的缺陷。本发明还提供了该探针的制备方法及应用。