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本发明公开了一种自吸交替式萃取装置、系统及方法，属于萃取装置技术领域，为解决现有装置造价高、难以消除乳化等问题而设计。本发明自吸交替式萃取装置包括驱动装置和混合槽，混合槽用于装有待萃取物和萃取物；混合槽内沿竖向设置有转轴；在混合槽内设置有至少一根呈L形的中空的搅拌器，搅拌器固定在转轴上；搅拌器上靠近转轴的第一端位于待萃取物或萃取物之一中，搅拌器上远离转轴的第二端位于待萃取物或萃取物另一中。本发明自吸交替式萃取装置、系统及方法保证互不相溶的两种待萃取物能互相在对方中均匀分布，萃取率高；结构简单、造价低，不易乳化。