本发明涉及一种α-亚麻酸分子印迹聚合物材料的制备方法，步骤如下：将α-亚麻酸和β-环糊精加至容器中，再加入二甲基亚砜，搅拌包合，得α-亚麻酸预聚合溶液；再加入六亚甲基二异氰酸酯或甲苯-2，4-二异氰酸酯，聚合得α-亚麻酸聚合颗粒；将其冷却，洗涤、干燥、研磨得α-亚麻酸分子印迹聚合物材料。本发明α-亚麻酸印迹聚合物材料的制备方法是以α-亚麻酸为模板分子、以β-环糊精为功能单体的，β-环糊精含有多羟基基团，且具有内疏水、外亲水的特性并含有较多的功能性羟基，能够充分包合α-亚麻酸，交联形成包合有α-亚麻酸的聚合物，洗脱后形成具有与α-亚麻酸相一致的印迹孔穴，从而得到对α-亚麻酸具有较高专一选择吸附功能的印迹聚合物材料。