本发明涉及一种利用复合生物酶制备菊苣仔根浓缩汁的方法，具体步骤如下：将菊苣仔根洗净、破碎、烫漂5-10分钟后，再使用果胶酶与纤维素酶组成的复合生物酶制剂进行酶解，粗滤、低温静置过夜、高温沉降、精滤后再进行真空浓缩，即得菊苣仔根浓缩汁，再将其经紫外线杀菌后，灌装贮藏。本发明所制得的菊苣仔根浓缩汁作为菊苣仔根深加工产品，菊苣仔根浓缩汁可以在保持其原有的天然成分的基础上解决贮存方面的问题，延长了保存期限，为菊苣仔根的综合运用开辟了一条新的发展道路，市场前景广阔。