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本发明涉及一种基于线阵射线源的锥束CT系统，其包括：线阵射线源、准直器、平板探测器、样品台、电力控制模块以及计算机。线阵射线源包括N个子射线源，N≥2，每个子射线源的射线束发射锥角平板探测器接收由N个子射线源发射并经过目标的射线；计算机建立目标的投影图像；计算机与电力控制模块电连接，线阵射线源与样品台的相对位置在电力控制模块控制下可调；电力控制模块为线阵射线源、样品台与平板探测器提供电源与控制信号。本发明相比传统的单射线源单次圆周扫描，减小了射线源的射线束发射锥角，降低了FDK重建算法产生的锥角效应，改善了CT重建图像质量，同时具有扫描效率高、系统结构简单、成本低、辐射剂量低的优势。