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本发明涉及水资源分配利用技术领域，特别涉及一种三层次水量分配方法，第一步是三层水资源的分配调节，其采用如下的步骤：a.第一层分配为时间层面水量分配；b.第二层次为空间层面分配，实现区域间水量分配；c.第三层为用户间水量分配，主要是指同一区域内不同类型用水户的水量分配；第二步是根据步骤一，对三层次水资源配比计算结构方法采用如下的步骤：a.计算框架采用面向对象程序设计，模型功能的实现由三个层次构成；b.总体流程包含了时间、空间、水源和用户的多重循环，不同层次的循环有对应数据信息变化和参数更新；它具有能够合理形成从用户、区域到时间的三层次分配结果，从而最大限度地合理化使用水资源，环保节能。