本发明涉及一种真鲷鱼胶原蛋白多肽-铬(III)螯合物的加工方法，以真鲷鱼鱼皮、鱼鳞为原料，鱼鳞粉碎制成鱼鳞粉，采用乳酸浸泡鱼鳞粉脱钙，将鱼鳞粉、鱼皮分别在超声波作用下用正己烷脱脂，用超声-氯化钠协同作用分别对鱼鳞粉、鱼皮进行脱杂蛋白；将鱼鳞粉、鱼皮按一定的比例用胰蛋白酶酶解，将水解液用活性炭粉末进行脱腥，得到胶原蛋白肽液，喷雾干燥制得粉末；将胶原蛋白肽粉末与CrCl3·6H2O充分粉碎混合进行微波固相螯合反应，加无水乙醇溶解去除非螯合物，不溶物干燥后为胶原蛋白多肽-铬(III)螯合物。本发明提供的胶原蛋白多肽-铬(III)螯合物制备过程安全、无污染，使鱼加工低值副产物或下脚料-鱼皮和鳞得到有效和高值化利用，原料利用率高，加工成本低，有重要的社会经济意义。