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一种微生物水动力学实验装置，其特征在于所述实验装置包括由两筒型结构的内筒、外筒同心设置构成的环形结构水槽，该水槽内承载实验流体；所述内筒和外筒由驱动装置绕所述同心的圆点驱动进行逆方向的转动设置。该微生物水动力学实验装置的结构设计合理、模拟环境真实，该实验装置能在环形水槽的中心环面产生持续稳定的剪切流。采用本实验装置能实现长时间循环运行的水平剪切流水力学条件，该试验装置不对水体产生扰动，稳定性好，并且无需配置不同密度的水体，也不会在运行过程中对水体中的微生物产生伤害。