本发明公开了一种自驱动式丝藻培养装置，包括反应室，反应室的底部设置有产碳板，反应室的中部悬挂有富集板，反应室的顶部设有电阻或是低功率电器，产碳板和富集板均通过导线与电阻相连。反应室内由上至下分别为空气，水，沉积物。产碳板埋置于沉积物中，富集板悬挂或漂浮于水中，代培养丝藻接种于富集层水体。利用本发明可以通过产碳板将微生物氧化沉积物时生产的电能和化学能用于丝藻的培养和生产，利用电化学系统将沉积物分解产生的无机碳供给丝藻生长。本发明完全不需要外加能源，制造出的丝藻可用于生产食物、饲料、化妆品和制药行业。丝藻培养过程中不排放废气废物，达到了资源的合理利用和环境友好的效果，具有很大的社会、经济价值。